Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp4r3aQ6P2K6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp4r3aQ6P2K6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms