Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Paxip1Q6NZQ4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Paxip1Q6NZQ4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Paxip1Q6NZQ4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Paxip1Q6NZQ4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Paxip1Q6NZQ4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Paxip1Q6NZQ4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Paxip1Q6NZQ4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Paxip1Q6NZQ4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Paxip1Q6NZQ4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Paxip1Q6NZQ4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Paxip1Q6NZQ4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Paxip1Q6NZQ4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Paxip1Q6NZQ4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Paxip1Q6NZQ4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Paxip1Q6NZQ4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Paxip1Q6NZQ4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Paxip1Q6NZQ4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms