Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc66Q6NS45 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc66Q6NS45 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms