Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NipblQ6KCD5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NipblQ6KCD5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NipblQ6KCD5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms