Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CltbQ6IRU5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CltbQ6IRU5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.5 ms