Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Nop58Q6DFW4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nop58Q6DFW4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nop58Q6DFW4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms