Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ric1Q69ZJ7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ric1Q69ZJ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ric1Q69ZJ7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ric1Q69ZJ7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ric1Q69ZJ7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ric1Q69ZJ7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ric1Q69ZJ7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ric1Q69ZJ7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ric1Q69ZJ7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ric1Q69ZJ7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ric1Q69ZJ7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ric1Q69ZJ7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ric1Q69ZJ7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ric1Q69ZJ7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ric1Q69ZJ7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ric1Q69ZJ7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ric1Q69ZJ7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ric1Q69ZJ7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ric1Q69ZJ7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Ric1Q69ZJ7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ric1Q69ZJ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ric1Q69ZJ7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ric1Q69ZJ7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ric1Q69ZJ7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ric1Q69ZJ7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms