Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zcchc2Q69ZB8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc2Q69ZB8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc2Q69ZB8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms