Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrcc1Q69ZB0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrcc1Q69ZB0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms