Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sbno1Q689Z5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Sbno1Q689Z5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sbno1Q689Z5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Sbno1Q689Z5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms