Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnna3Q65CL1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnna3Q65CL1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms