Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VclQ64727 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VclQ64727 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VclQ64727 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VclQ64727 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VclQ64727 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VclQ64727 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VclQ64727 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VclQ64727 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VclQ64727 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VclQ64727 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VclQ64727 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VclQ64727 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VclQ64727 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VclQ64727 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VclQ64727 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VclQ64727 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VclQ64727 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VclQ64727 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VclQ64727 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VclQ64727 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VclQ64727 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VclQ64727 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VclQ64727 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VclQ64727 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VclQ64727 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VclQ64727 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VclQ64727 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VclQ64727 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VclQ64727 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VclQ64727 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VclQ64727 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VclQ64727 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VclQ64727 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VclQ64727 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VclQ64727 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VclQ64727 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VclQ64727 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VclQ64727 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VclQ64727 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VclQ64727 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VclQ64727 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VclQ64727 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VclQ64727 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VclQ64727 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VclQ64727 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VclQ64727 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VclQ64727 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VclQ64727 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VclQ64727 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VclQ64727 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VclQ64727 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VclQ64727 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VclQ64727 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VclQ64727 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VclQ64727 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VclQ64727 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VclQ64727 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VclQ64727 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VclQ64727 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VclQ64727 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VclQ64727 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VclQ64727 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VclQ64727 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VclQ64727 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VclQ64727 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VclQ64727 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VclQ64727 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VclQ64727 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VclQ64727 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VclQ64727 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VclQ64727 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VclQ64727 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VclQ64727 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VclQ64727 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VclQ64727 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VclQ64727 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VclQ64727 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VclQ64727 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VclQ64727 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VclQ64727 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VclQ64727 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VclQ64727 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VclQ64727 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VclQ64727 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VclQ64727 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VclQ64727 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VclQ64727 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VclQ64727 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VclQ64727 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VclQ64727 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VclQ64727 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VclQ64727 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VclQ64727 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VclQ64727 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VclQ64727 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VclQ64727 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VclQ64727 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VclQ64727 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VclQ64727 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms