Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clcn1Q64347 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clcn1Q64347 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clcn1Q64347 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
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Clcn1Q64347 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
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Clcn1Q64347 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
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Clcn1Q64347 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
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Clcn1Q64347 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Clcn1Q64347 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
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Clcn1Q64347 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clcn1Q64347 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
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