Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps72Q62481 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vps72Q62481 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps72Q62481 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms