Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Kdm5dQ62240 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Kdm5dQ62240 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
Kdm5dQ62240 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
Kdm5dQ62240 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
Kdm5dQ62240 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Kdm5dQ62240 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Kdm5dQ62240 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Kdm5dQ62240 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Kdm5dQ62240 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Kdm5dQ62240 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Kdm5dQ62240 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
Kdm5dQ62240 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Kdm5dQ62240 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Kdm5dQ62240 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Kdm5dQ62240 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Kdm5dQ62240 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
Kdm5dQ62240 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Kdm5dQ62240 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Kdm5dQ62240 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
Kdm5dQ62240 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
Kdm5dQ62240 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Kdm5dQ62240 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Kdm5dQ62240 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Kdm5dQ62240 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Kdm5dQ62240 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Kdm5dQ62240 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Kdm5dQ62240 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Kdm5dQ62240 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Kdm5dQ62240 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Kdm5dQ62240 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
Kdm5dQ62240 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Kdm5dQ62240 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Kdm5dQ62240 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Kdm5dQ62240 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Kdm5dQ62240 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Kdm5dQ62240 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Kdm5dQ62240 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Kdm5dQ62240 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Kdm5dQ62240 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Kdm5dQ62240 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Kdm5dQ62240 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Kdm5dQ62240 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Kdm5dQ62240 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Kdm5dQ62240 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Kdm5dQ62240 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Kdm5dQ62240 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Kdm5dQ62240 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Kdm5dQ62240 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Kdm5dQ62240 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Kdm5dQ62240 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Kdm5dQ62240 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC40.06■■■■■ 4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms