Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Six2Q62232 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Six2Q62232 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Six2Q62232 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Six2Q62232 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Six2Q62232 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Six2Q62232 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Six2Q62232 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Six2Q62232 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Six2Q62232 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Six2Q62232 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Six2Q62232 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Six2Q62232 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms