Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phox2aQ62066 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phox2aQ62066 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phox2aQ62066 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms