Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctr9Q62018 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctr9Q62018 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms