Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Npm1Q61937 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Npm1Q61937 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Npm1Q61937 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Npm1Q61937 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Npm1Q61937 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Npm1Q61937 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Npm1Q61937 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Npm1Q61937 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Npm1Q61937 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Npm1Q61937 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms