Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga7Q61738 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga7Q61738 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms