Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pacsin1Q61644 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pacsin1Q61644 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pacsin1Q61644 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms