Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msi1Q61474 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msi1Q61474 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms