Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rbbp4Q60972 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp4Q60972 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp4Q60972 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms