Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Meis1Q60954 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Meis1Q60954 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Meis1Q60954 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Meis1Q60954 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms