Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk2a1Q60737 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms