Protein–RNA interactions for Protein: Q60720

Cyb561, Cytochrome b561, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561Q60720 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyb561Q60720 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyb561Q60720 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms