Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E0

Lhfpl4, LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl4Q5U4E0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lhfpl4Q5U4E0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lhfpl4Q5U4E0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms