Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Med13Q5SWW4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Med13Q5SWW4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Med13Q5SWW4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Med13Q5SWW4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med13Q5SWW4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med13Q5SWW4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms