Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r223Q5SSA0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms