Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bod1Q5SQY2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bod1Q5SQY2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bod1Q5SQY2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.6 ms