Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc85aQ5SP85 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms