Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna2d4Q5RJF7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms