Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trdv4Q5R1A3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trdv4Q5R1A3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms