Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scarf1Q5ND28 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scarf1Q5ND28 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms