Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5431Q5NCB3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5431Q5NCB3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms