Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Taf3Q5HZG4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf3Q5HZG4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Taf3Q5HZG4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Taf3Q5HZG4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Taf3Q5HZG4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Taf3Q5HZG4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Taf3Q5HZG4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Taf3Q5HZG4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Taf3Q5HZG4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Taf3Q5HZG4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Taf3Q5HZG4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Taf3Q5HZG4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms