Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufaf2Q59J78 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms