Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf354cQ571J5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms