Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmtc2Q56A06 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmtc2Q56A06 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms