Protein–RNA interactions for Protein: Q4KUS1

Wfdc8, WAP four-disulfide core domain protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wfdc8Q4KUS1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Wfdc8Q4KUS1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Wfdc8Q4KUS1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Wfdc8Q4KUS1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms