Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5935Q497S0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm5935Q497S0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5935Q497S0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms