Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Esf1Q3V1V3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Esf1Q3V1V3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Esf1Q3V1V3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Esf1Q3V1V3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Esf1Q3V1V3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Esf1Q3V1V3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Esf1Q3V1V3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Esf1Q3V1V3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Esf1Q3V1V3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Esf1Q3V1V3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Esf1Q3V1V3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Esf1Q3V1V3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Esf1Q3V1V3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Esf1Q3V1V3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Esf1Q3V1V3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Esf1Q3V1V3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Esf1Q3V1V3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Esf1Q3V1V3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Esf1Q3V1V3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Esf1Q3V1V3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Esf1Q3V1V3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Esf1Q3V1V3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Esf1Q3V1V3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Esf1Q3V1V3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Esf1Q3V1V3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Esf1Q3V1V3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Esf1Q3V1V3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Esf1Q3V1V3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Esf1Q3V1V3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Esf1Q3V1V3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Esf1Q3V1V3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms