Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd5Q3V1H9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms