Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ckap2Q3V1H1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ckap2Q3V1H1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms