Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc110Q3V125 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc110Q3V125 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms