Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc185Q3V118 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc185Q3V118 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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