Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd53Q3V0J4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd53Q3V0J4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd53Q3V0J4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd53Q3V0J4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd53Q3V0J4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd53Q3V0J4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd53Q3V0J4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd53Q3V0J4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd53Q3V0J4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd53Q3V0J4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd53Q3V0J4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd53Q3V0J4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd53Q3V0J4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ankrd53Q3V0J4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ankrd53Q3V0J4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ankrd53Q3V0J4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ankrd53Q3V0J4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms