Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc9Q3V038 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms