Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc55Q3UY51 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc55Q3UY51 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc55Q3UY51 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc55Q3UY51 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc55Q3UY51 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc55Q3UY51 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc55Q3UY51 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc55Q3UY51 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc55Q3UY51 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc55Q3UY51 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc55Q3UY51 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrc55Q3UY51 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc55Q3UY51 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc55Q3UY51 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc55Q3UY51 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms