Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn13Q3UW68 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.2 ms